Jupyter(notebook & Lab)에서 R 실행하기(Windows10 & Ubuntu)
파이썬만 설치된 Jupyter(notebook & Lab)에 R 커널을 추가하여 R을 실행할 수 있다.
Jupyter를 설치한 경우 파이썬만 kernel로 설정되어 있다. Jupyter에서 R을 활용하기 위해서는 R kernel을 설정해야 한다.
R을 실행하기 위해서 두 가지의 경우로 생각해 볼 수 있다.
- Anaconda를 통해 R 설치
- R을 따로 설치한 경우
Anaconda 환경에서 R 설치
conda를 활용하여 R과 IRkernel을 동시에 설치한다.
conda install r-irkernel
이 설치만으로 R을 바로 Jupyter에서 사용할 수 있다.
R을 따로 설치한 경우
R에서 실행해야할 코드는 Rstudio가 아닌 R 자체에서 사용해야 한다.
Windows 10
install.packages('devtools')
devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')
IRkernel::installspec()
IRkernel::installspec() 실행 시 다음과 같은 오류가 생길 수 있다.
Error in IRkernel::installspec() :
jupyter-client has to be installed but “jupyter kernelspec –version” exited with code 127.
이럴 경우에는 환경변수 PATH에 anaconda를 추가해야 한다.
내 PC - 우클릭 - 속성 - 고급 시스템 설정 - 환경 변수 - 시스템 변수 중 Path 편집
Anaconda(Miniconda) 설치 경로 + @ 총 3가지를 지정해준다.
다시 IRkernel::installspec()을 실행하면 된다.
참고 : 환경변수를 지정하고 나면 anaconda prompt가 아닌 cmd에서도 conda 명령어를 사용할 수 있다.
Ubuntu(16.04 기준)
우분투에서는 먼저 터미널을 활용해 다음 명령어를 실행한다.
sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev # curl 설치를 위해
sudo apt-get install libzmq3-dev # pbdZMq 설치를 위해
그 후에 터미널에서 R을 실행하고 다음 코드를 입력한다.
install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon', 'pbdZMQ',
'devtools', 'uuid', 'digest'))
devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')
IRkernel::installspec()
#IRkernel::installspec(user=FALSE) # 시스템 전체 설치
설정 완료 시
kernelspec list를 보면 R이 추가된 것을 확인할 수 있다. 이제 Jupyter에서 R을 선택해서 실행할 수 있다.
참고
다음과 같은 오류가 생길 경우,
# 패키지가 없다고 나올 경우, install만
remove.packages(c("curl","httr"))
install.packages(c("curl", "httr"))
References :